Az Agrárminiszter a 3/2018. (X. 25.) AM utasítással kiadta a Nébih Szervezeti és Működési Szabályzatát, amely részletesen meghatározza a hivatal működését, felépítését és feladatait.

Jelen Szervezeti és Működési Szabályzat a Nemzeti Élelmiszerlánc-biztonsági Hivatal személyi állományával, vezetőivel, szervezeti egységeinek felépítésével, a Nébih feladatkörével és működésével, valamint a Nébih és az általa alapított Élelmiszerlánc-biztonsági Centrum Nonprofit Korlátolt Felelősségű Társaság (a továbbiakban: ÉLBC) közötti szakmai együttműködéssel kapcsolatos rendelkezéseket tartalmazza. Az SZMSZ itt érhető el.